1、納稅主體不明晰

掛靠經(jīng)營是一種借用關(guān)系，呈現(xiàn)的法律關(guān)系具有復(fù)雜性，常見類型是借用資質(zhì)。掛靠方和被掛靠方是獨(dú)立的民事主體，也應(yīng)是兩個(gè)獨(dú)立納稅主體，而掛靠經(jīng)營表現(xiàn)為交易個(gè)人冒用法人資格或特定資質(zhì)行事，使得市場交易變得主體模糊，納稅主體隨之不明晰。例如某市甲醫(yī)藥經(jīng)銷公司與乙醫(yī)院簽有醫(yī)藥供應(yīng)合同，但向醫(yī)院銷售的藥品由掛靠到甲公司丙個(gè)人提供，醫(yī)院銷貨款通過甲公司轉(zhuǎn)給丙，甲公司負(fù)責(zé)配送藥品并收取一定費(fèi)用，甲公司不明晰本身應(yīng)作為納稅主體申報(bào)納稅，而讓丙個(gè)人作為納稅主體，到稅務(wù)機(jī)關(guān)代開發(fā)票納稅，后被稅務(wù)稽查部門查處。

2、會計(jì)核算不規(guī)范

從法律上講，掛靠方與被掛靠方地位平等，掛靠方的經(jīng)營方式是自主經(jīng)營、自負(fù)盈虧，財(cái)務(wù)獨(dú)立核算。而現(xiàn)實(shí)中由于掛靠方投到被掛靠方旗下，被掛靠方?jīng)]有按規(guī)定的財(cái)務(wù)制度規(guī)定對掛靠方經(jīng)營成果進(jìn)行核算，對掛靠方購進(jìn)的庫存商品不入賬或沒有單獨(dú)記賬，或者設(shè)賬外賬、制作虛假入庫單；雙方銷售收入混在一起核算；被掛靠方收取掛靠方的管理費(fèi)沒有單獨(dú)核算納稅；被掛靠方只對掛靠經(jīng)營者票據(jù)審核核算，對其購進(jìn)、銷售的商品交易性質(zhì)劃分不清，因而掛靠經(jīng)營者虛取、虛開發(fā)票風(fēng)險(xiǎn)極高。

3、發(fā)票使用不合規(guī)

掛靠方在用被掛靠方資質(zhì)經(jīng)營時(shí)，如被掛靠方是增值稅一般納稅人，其按照掛靠方銷售額1-1.5%收取管理費(fèi)，前提是掛靠方需取得購貨進(jìn)項(xiàng)增值稅發(fā)票，否則按照掛靠方銷售額7-8%收取管理費(fèi)。掛靠方如購貨未取得發(fā)票，便會通過非法途徑購買發(fā)票交給被掛靠方抵扣稅款，如其銷售對象不需要發(fā)票，又會對第三方虛開發(fā)票，非法獲利；而被掛靠方在沒有取得掛靠方購進(jìn)增值稅發(fā)票時(shí)，便會買票抵扣稅款，還會向下游企業(yè)虛開發(fā)票，此時(shí)被掛靠經(jīng)營方收取的管理費(fèi)實(shí)際上是開票手續(xù)費(fèi)，涉嫌虛開發(fā)票。掛靠和被掛靠雙方使用發(fā)票不合規(guī)，都會走上刑事犯罪道路。

4、稅款繳納不正確

由于掛靠經(jīng)營隱含著上述三個(gè)潛在涉稅問題，導(dǎo)致掛靠雙方在納稅申報(bào)及稅款繳納出現(xiàn)錯(cuò)誤。如第1個(gè)涉稅問題中，甲醫(yī)藥經(jīng)銷公司應(yīng)作為納稅主體，向乙醫(yī)院開具增值稅專用發(fā)票，應(yīng)按開具發(fā)票金額申報(bào)納稅，而甲公司讓掛靠銷售個(gè)人到稅務(wù)機(jī)關(guān)代開發(fā)票，導(dǎo)致少交增值稅和企業(yè)所得稅，雖沒按偷稅進(jìn)行處罰，卻要承擔(dān)補(bǔ)繳稅款、滯納金的責(zé)任。由于掛靠經(jīng)營雙方在財(cái)務(wù)管理、發(fā)票使用上的不規(guī)范運(yùn)作，一旦涉嫌虛開發(fā)票，不但要受到補(bǔ)稅、罰款等處罰，還要被追究刑事責(zé)任。如某市D藥品藥材有限公司打著掛靠經(jīng)營的幌子，在經(jīng)營三年期間采取虛構(gòu)資金流、偽造賬簿資料、變更發(fā)票清單等手段，從上游取得虛開中草藥發(fā)票抵扣稅款，并向下游11戶企業(yè)虛開發(fā)票，造成該企業(yè)和受票企業(yè)少交增值稅、企業(yè)所得稅，涉案當(dāng)事人因涉嫌逃避繳納稅款和虛開發(fā)票罪，被移送司法機(jī)關(guān)處理。